39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0438 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0438  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 383 aa  792    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000351893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  29.75 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  29.78 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  30.77 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  31.33 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  27.73 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  29.3 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  27.71 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  29.73 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  26.21 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  22.81 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  27.93 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  28.42 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  29.65 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  24.18 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  27.53 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  27.89 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  28.91 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  29.5 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  26.67 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  25.07 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.79 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  26.75 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  25.95 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  28.34 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  27.92 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  25.5 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  26.24 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  28.98 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  30.45 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  29.01 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  25.85 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  29.9 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  28.4 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  26.39 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  28.07 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  28.66 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  26.48 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>