142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3254 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  100 
 
 		 390 aa  797    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  67.1 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  66.07 
 
 		 383 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  65.71 
 
 		 381 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  59.07 
 
 		 385 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  59.84 
 
 		 385 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  62.27 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  60.71 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  62.02 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  59.9 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  59.9 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  58.31 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  58.21 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  56.89 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  58.73 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  56.64 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  55.1 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  54.48 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  54.9 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  54.5 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  51.93 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  53.06 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  53.91 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  50.25 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  52.81 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  50.13 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  51.79 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  50.26 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  51.59 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  48.97 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  50.26 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  50.26 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  48.16 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  45.5 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2180  xylose isomerase  36.15 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000174675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2688  xylose isomerase  35.71 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1219  xylose isomerase  30.48 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0226  xylose isomerase  29.74 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.829605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0603  xylose isomerase  32.16 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1733  xylose isomerase  31.15 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.382603  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0454  xylose isomerase  31.47 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0153  xylose isomerase  32.42 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1871  xylose isomerase  30.26 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.322052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0547  xylose isomerase  31.1 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1124  xylose isomerase  29.77 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1162  xylose isomerase  29.77 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000276678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2443  xylose isomerase  28.87 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3709  xylose isomerase  31.5 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3411  xylose isomerase  31.1 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2342  xylose isomerase  29.62 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2210  xylose isomerase  28.96 
 
 		 445 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  32.17 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2789  xylose isomerase  30.71 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3411  xylose isomerase  30.31 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0549  xylose isomerase  30.71 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1287  xylose isomerase  31.16 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1757  xylose isomerase  31.66 
 
 		 444 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_30786  xylose isomerase  31.25 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19530  xylose isomerase  27.46 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3832  xylose isomerase  30.71 
 
 		 435 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6032  xylose isomerase  29.84 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383264  normal  0.793977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3039  xylose isomerase  27.22 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0349  xylose isomerase  28.12 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6506  xylose isomerase  29.88 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254155  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6332  xylose isomerase  29.44 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6740  xylose isomerase  29.88 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0817214  normal  0.561733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6329  xylose isomerase  29.88 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4207  xylose isomerase  30.59 
 
 		 440 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4384  xylose isomerase  29.48 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0452947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1996  xylose isomerase  27.95 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00412566  normal  0.553751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6633  xylose isomerase  28.97 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2622  xylose isomerase  28.97 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2615  xylose isomerase  28.35 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3429  xylose isomerase  26.62 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2338  xylose isomerase  28.97 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.87 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1604  xylose isomerase  31.64 
 
 		 442 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0078  xylose isomerase  27.34 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0587  xylose isomerase  25.06 
 
 		 441 aa  87  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0060  xylose isomerase  28.29 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1596  xylose isomerase  33.13 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0130  xylose isomerase  30.65 
 
 		 448 aa  86.7  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00829449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2838  xylose isomerase  27.95 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0695629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00110  xylose isomerase  27.73 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03848  xylose isomerase  27.73 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1176  xylose isomerase  27.95 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0800628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0029  xylose isomerase  28.64 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3726  xylose isomerase  26.94 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1929  xylose isomerase  26.87 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116682  normal  0.849458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3002  xylose isomerase  26.59 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4723  xylose isomerase  31.67 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2001  xylose isomerase  31.13 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1876  xylose isomerase  26.48 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0098  xylose isomerase  26.15 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2714  xylose isomerase  29.48 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4102  xylose isomerase  28.74 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4161  xylose isomerase  28.74 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.0336803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0056  xylose isomerase  28.74 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4155  xylose isomerase  25.39 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>