154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1262 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  100 
 
 
382 aa  776    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  59.74 
 
 
390 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  60.67 
 
 
389 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  60.67 
 
 
389 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  59.58 
 
 
382 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  59.07 
 
 
386 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  58.58 
 
 
387 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  58.2 
 
 
403 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  58.4 
 
 
385 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  58.4 
 
 
381 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  57.89 
 
 
389 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  56.74 
 
 
407 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  55.2 
 
 
385 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  57.07 
 
 
383 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  56.65 
 
 
379 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  57.14 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  53.6 
 
 
385 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  56.32 
 
 
386 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  55.44 
 
 
395 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  55.44 
 
 
395 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  54.28 
 
 
387 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  55.08 
 
 
396 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  53.37 
 
 
395 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  51.02 
 
 
395 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  51.55 
 
 
397 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  52.97 
 
 
407 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  51.76 
 
 
393 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  49.87 
 
 
393 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  49.22 
 
 
392 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  50.65 
 
 
396 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  51.44 
 
 
405 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  51.59 
 
 
390 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  47.81 
 
 
397 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  44.85 
 
 
384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1287  xylose isomerase  31.61 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2180  xylose isomerase  31.11 
 
 
441 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000174675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1124  xylose isomerase  31.02 
 
 
444 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1162  xylose isomerase  31.02 
 
 
444 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000276678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19530  xylose isomerase  30.42 
 
 
439 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1757  xylose isomerase  32.7 
 
 
444 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2688  xylose isomerase  33.72 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0603  xylose isomerase  28.61 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3429  xylose isomerase  30.42 
 
 
439 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1929  xylose isomerase  32.59 
 
 
442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116682  normal  0.849458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0226  xylose isomerase  29.87 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.829605  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1871  xylose isomerase  30.32 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.322052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2443  xylose isomerase  28.35 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2001  xylose isomerase  29.65 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2210  xylose isomerase  30.27 
 
 
445 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0153  xylose isomerase  32.3 
 
 
438 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0349  xylose isomerase  30.13 
 
 
443 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1604  xylose isomerase  30.03 
 
 
442 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1219  xylose isomerase  29.38 
 
 
438 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0130  xylose isomerase  29 
 
 
448 aa  106  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00829449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4207  xylose isomerase  30.03 
 
 
440 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173601  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_30786  xylose isomerase  28.85 
 
 
445 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6332  xylose isomerase  28.02 
 
 
440 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3832  xylose isomerase  31.18 
 
 
435 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6032  xylose isomerase  29.35 
 
 
440 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383264  normal  0.793977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2504  xylose isomerase  31.49 
 
 
443 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.149653  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2338  xylose isomerase  30.64 
 
 
440 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6506  xylose isomerase  29.35 
 
 
440 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0060  xylose isomerase  29.07 
 
 
439 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6740  xylose isomerase  29.35 
 
 
440 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0817214  normal  0.561733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6329  xylose isomerase  29.35 
 
 
440 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158515  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2789  xylose isomerase  32.05 
 
 
436 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4102  xylose isomerase  29.6 
 
 
439 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0078  xylose isomerase  28.85 
 
 
439 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4161  xylose isomerase  28.85 
 
 
439 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.0336803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0056  xylose isomerase  29.6 
 
 
439 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3411  xylose isomerase  31.18 
 
 
436 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3709  xylose isomerase  31.27 
 
 
436 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  31.5 
 
 
436 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0098  xylose isomerase  27.93 
 
 
439 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4155  xylose isomerase  29.19 
 
 
440 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0454  xylose isomerase  27.42 
 
 
399 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1733  xylose isomerase  27.67 
 
 
436 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.382603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4384  xylose isomerase  29.49 
 
 
446 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0452947  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3939  xylose isomerase  28.8 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.619988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3984  xylose isomerase  28.8 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3857  xylose isomerase  28.8 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3875  xylose isomerase  28.8 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4044  xylose isomerase  28.8 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2622  xylose isomerase  30.99 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1596  xylose isomerase  29.28 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00110  xylose isomerase  31.43 
 
 
445 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03848  xylose isomerase  31.43 
 
 
445 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0156  xylose isomerase  29.2 
 
 
440 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0547  xylose isomerase  30.89 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4437  xylose isomerase  29.2 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6633  xylose isomerase  30.17 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1176  xylose isomerase  30.89 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0800628  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3411  xylose isomerase  30.89 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4723  xylose isomerase  29.34 
 
 
442 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03417  xylose isomerase  28.4 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2838  xylose isomerase  30.89 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0695629  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3768  xylose isomerase  28.4 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.986128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4061  xylose isomerase  28.4 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3959  xylose isomerase  28.4 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4941  xylose isomerase  28.4 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0307022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>