127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2108 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  100 
 
 		 323 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  51.39 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  54.45 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.78 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  34.28 
 
 		 709 aa  189  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  38.36 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.99 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  30.1 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  27.68 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  27.68 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  29.37 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  25.54 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  30.29 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  28.51 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  29.46 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  27.56 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.49 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  24.22 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.38 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  35.83 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  26.48 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  27.41 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  28.05 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  27.72 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  26.23 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  32.61 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  29.72 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  30.1 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  28.77 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  28.22 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  30.46 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  31 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.93 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.07 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  20.6 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  26.91 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  26.59 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  30.1 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  29.59 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  27.39 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  29.23 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  26.95 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  29.23 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  29.23 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  25.16 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  30.46 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  33.33 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  26.74 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  32.9 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 424 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  28.23 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  28.02 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.85 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  26.49 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  28.12 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  28.79 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  31.69 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  27.05 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  26.51 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.62 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  29.19 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  28.21 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  26.1 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  26.84 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  27.75 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  27.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  27.62 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  31.52 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  26.79 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  26.51 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  27.31 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  28.65 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  29.63 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  27.96 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  27.2 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  25.79 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  24.53 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  28.57 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  28.14 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  33.33 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  28.68 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  24.44 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3411  xylose isomerase  23.72 
 
 		 435 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  24.1 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0547  xylose isomerase  25.83 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2789  xylose isomerase  26.24 
 
 		 436 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0549  xylose isomerase  22.61 
 
 		 435 aa  49.3  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  28.3 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3709  xylose isomerase  27.07 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2210  xylose isomerase  26.09 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2443  xylose isomerase  26.28 
 
 		 438 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  25.39 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0156  xylose isomerase  23.08 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4207  xylose isomerase  24.65 
 
 		 440 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1219  xylose isomerase  26.95 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2622  xylose isomerase  27.62 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6506  xylose isomerase  24.24 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254155  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6740  xylose isomerase  24.24 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0817214  normal  0.561733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6633  xylose isomerase  27.62 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>