64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4391 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  98.69 
 
 		 382 aa  782    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  100 
 
 		 382 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 382 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  78.63 
 
 		 388 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  78.57 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  77.78 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  74.87 
 
 		 387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  72.85 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  71.85 
 
 		 388 aa  557  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  69.05 
 
 		 392 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  67.88 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  68.95 
 
 		 392 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  67.83 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  66.4 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  67.18 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  65.18 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  53.51 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  51.68 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  52.55 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  51.36 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  50.27 
 
 		 382 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  51.82 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  49.87 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  55.05 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.66 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.49 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  42.6 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  40.43 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  41.6 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.51 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  42.4 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.87 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  41.36 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  42.36 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  39.84 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.69 
 
 		 424 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  41.02 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  41.29 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  38.56 
 
 		 427 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  30.28 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  29.23 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.54 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  27.14 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  27.27 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  27.49 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  28.42 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  24.78 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  26.06 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  25.99 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  27.54 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  27.6 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  27.08 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  26.47 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  28.1 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  25.37 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  26.56 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  29.33 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  27.66 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  25.76 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  24.73 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  26.01 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  26.23 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  23.3 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>