70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3107 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  94.07 
 
 		 388 aa  761    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 388 aa  800    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  78.04 
 
 		 382 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  77.78 
 
 		 382 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  78.1 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  77.84 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  77.78 
 
 		 382 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  71.65 
 
 		 387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  71.96 
 
 		 392 aa  566  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  72.75 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  67.34 
 
 		 398 aa  554  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  69.79 
 
 		 392 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  67.01 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  67.29 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  66.24 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  68.07 
 
 		 390 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  54.79 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  52.71 
 
 		 405 aa  411  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  55.26 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  51.33 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  52.21 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  51.06 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  48.95 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  53.32 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.39 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.56 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  43.22 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  43.19 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  42.97 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  43.6 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  42.56 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  41.28 
 
 		 428 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.56 
 
 		 424 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  43.9 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  44.95 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.41 
 
 		 424 aa  298  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.22 
 
 		 424 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  42.01 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  40.32 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  27.65 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.57 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  28.57 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  26.8 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.58 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.79 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  28.08 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  26.37 
 
 		 709 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  28 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  27.05 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  27 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  27.78 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  23.03 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  31.28 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  26.57 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  27.74 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  26.14 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  26.63 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  26.53 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  26.29 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  26.57 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  23.72 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  26.98 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  26.43 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  26.84 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  25.76 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  24.29 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  27.94 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  25 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  26.34 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>