59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4811 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 403 aa  813    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  61.54 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  60.56 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  54.76 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  55.09 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  51.67 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  53.75 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  53.62 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  57.14 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  49.74 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  52.51 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  50.13 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  50.26 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  49.62 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  50.26 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.77 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  51.6 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  50.39 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  51.41 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  49.87 
 
 		 388 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  50.53 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  46 
 
 		 430 aa  355  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  50.66 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  44.58 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  45.43 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  48.06 
 
 		 387 aa  342  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  44.09 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  43.39 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  48.66 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  48.66 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  48.66 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  43.98 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  42.33 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  42.58 
 
 		 430 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.13 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  43.26 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.38 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  41.82 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.61 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  26.65 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  31.49 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.9 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  29.39 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  27.2 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  30.57 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  28.98 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  30.69 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.81 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.14 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  26.55 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  29.74 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  31.86 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  27.88 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3262  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.78 
 
 		 1036 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  27.04 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  27.47 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2862  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1036 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  31.87 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  29.7 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>