70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2455 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  100 
 
 		 396 aa  806    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  71.54 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  67.6 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  61.64 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  57.18 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  61.94 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  58.75 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  53.91 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  52.74 
 
 		 382 aa  441  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  57.33 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  59.47 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  56.01 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  57.22 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  55.56 
 
 		 392 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  54.79 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.61 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  53.66 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  54.28 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  53.6 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  52.48 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  52.22 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  52.22 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  54.72 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  54.17 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  54.83 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.92 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  44.76 
 
 		 428 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  42.42 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  45.69 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  44.18 
 
 		 430 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  43.65 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  42.82 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  43.34 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  40.91 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.61 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.06 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.4 
 
 		 424 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  43.26 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  40.56 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.44 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  27.41 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  27.81 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  26.9 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  28.14 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  29.7 
 
 		 709 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  26.9 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  27.41 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  24.43 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  30.28 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  26.79 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  31.03 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  26.98 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  19.57 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  24.73 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  24.71 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  25.94 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  23.51 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1696  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.81 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  27.13 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4044  xylose isomerase  26.62 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3875  xylose isomerase  26.62 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3857  xylose isomerase  26.62 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3984  xylose isomerase  26.62 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3939  xylose isomerase  26.62 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.619988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  24.1 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4102  xylose isomerase  27.56 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0098  xylose isomerase  25.32 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4161  xylose isomerase  27.56 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667715  normal  0.0336803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0056  xylose isomerase  27.56 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>