79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1387 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 398 aa  817    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  77.32 
 
 		 391 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  72.66 
 
 		 392 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  73.18 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  70.98 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  68.09 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  71.24 
 
 		 390 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  67.34 
 
 		 388 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  71.35 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  69.35 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  70.62 
 
 		 392 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  67.88 
 
 		 382 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  67.88 
 
 		 382 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  67.88 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  65.66 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  66.16 
 
 		 388 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  54.43 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  54.17 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  53.78 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  53.32 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  53.6 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  49.21 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  51.32 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  55.12 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.62 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.66 
 
 		 428 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  44.65 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  44.92 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  45.19 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  44.65 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  43.85 
 
 		 430 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  43.86 
 
 		 430 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  45.93 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  43.9 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.08 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.45 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.3 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  41.44 
 
 		 427 aa  285  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  39.48 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  26.94 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  29.34 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  29.35 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  25.16 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  25.93 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  27.27 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  28.52 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  24.9 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  29.44 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  29.23 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  28.72 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  27.84 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  27.36 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  27.02 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  28.65 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  27.85 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  29.17 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  27.27 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  28.43 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  28.36 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  26.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  26.42 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0903  xylose isomerase  29.52 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.122683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  21.25 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  23.08 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  26.6 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  23.85 
 
 		 354 aa  46.6  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  25.19 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  25 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  27.62 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  26.42 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2820  xylose isomerase  25.79 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  26.74 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  26.13 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  22.95 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  25.86 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  25.91 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  28.63 
 
 		 386 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>