39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3455 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  88.97 
 
 		 427 aa  775    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  92.25 
 
 		 427 aa  764    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 428 aa  868    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  64.35 
 
 		 419 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 419 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  64.51 
 
 		 419 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  64.51 
 
 		 419 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  64.51 
 
 		 419 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  64.51 
 
 		 419 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  64.03 
 
 		 419 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  64.34 
 
 		 416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  64.66 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  64.66 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  63.79 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  63.79 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  64.9 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  64.75 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  64.75 
 
 		 420 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  63.79 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  65.14 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  61.15 
 
 		 421 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  63.46 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  59.09 
 
 		 423 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  55.24 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  57.84 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  54.07 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  55.34 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  30.05 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  25.99 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  25.99 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  30.58 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  26.3 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  26.64 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  26.67 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  25.61 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  28.49 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>