48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4214 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.29 
 
 		 424 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  79.25 
 
 		 424 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 424 aa  871    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  71.33 
 
 		 424 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  65.65 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.47 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  53.83 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  53.12 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  53.85 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  48.09 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  46.63 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  50.78 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  52.38 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  47.9 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  46.37 
 
 		 397 aa  348  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  44.13 
 
 		 396 aa  330  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  41.67 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  42.9 
 
 		 382 aa  323  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  42.38 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  41.27 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  40.05 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  42.63 
 
 		 388 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  40.05 
 
 		 409 aa  302  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  42.04 
 
 		 392 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  42.01 
 
 		 388 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  40.43 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  40.43 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  40.43 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.82 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  41.13 
 
 		 388 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  42.04 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  40.72 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  39.48 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  41.02 
 
 		 390 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  40.16 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  39.89 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  41.27 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  40.59 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  38.44 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 298 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  24.64 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  22.4 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  25.28 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  22.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  24.53 
 
 		 323 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.21 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  23.38 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>