53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3573 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  79.95 
 
 		 430 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  78.09 
 
 		 430 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  78.55 
 
 		 430 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  100 
 
 		 430 aa  894    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  72.12 
 
 		 430 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  67.46 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  66.35 
 
 		 429 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  61.93 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.48 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.07 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  55.56 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.96 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  52.38 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.55 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  46.88 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  45.36 
 
 		 408 aa  362  8e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  43.69 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.58 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  45.93 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  46.51 
 
 		 391 aa  326  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  44.97 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  42.46 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  42.54 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  44.68 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  44.95 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  45.17 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  45.14 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  43.24 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  42.93 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  40.31 
 
 		 382 aa  306  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  42.59 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  43.19 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  44.24 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  42.89 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  41.27 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  40.52 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  40.52 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  40.52 
 
 		 382 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  40.97 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  27.38 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  29.01 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.7 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  24.07 
 
 		 326 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  24.74 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  24.74 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  26.73 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  23.48 
 
 		 354 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.92 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  21.54 
 
 		 709 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0987  xylose isomerase  23.42 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0695  xylose isomerase  26.24 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  23.16 
 
 		 354 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>