82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0886 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 388 aa  797    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  78.63 
 
 		 382 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  78.63 
 
 		 382 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  78.63 
 
 		 382 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  80.42 
 
 		 388 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  77.84 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  74.23 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  76.44 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  71.69 
 
 		 392 aa  564  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  69.85 
 
 		 388 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  70.78 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  66.16 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  70.45 
 
 		 392 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  67.29 
 
 		 391 aa  524  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  70.18 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  67.46 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  56.56 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  54.18 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  56 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  56.28 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  53.62 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  51.6 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  49.74 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  56.1 
 
 		 394 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.6 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.16 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.81 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  45.41 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  45.7 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  44.88 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  43.54 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  43.24 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  43.78 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  43.72 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  42.63 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.19 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  45.17 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.16 
 
 		 424 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  41.05 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  27.98 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  28.05 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  24.78 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  26.1 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3592  xylose isomerase  28.37 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239598  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2175  xylose isomerase  29.53 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000407625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2430  xylose isomerase  28.95 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0181  xylose isomerase  28.14 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3973  xylose isomerase  28.37 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2064  xylose isomerase  28.64 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5294  xylose isomerase  27.4 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0704  xylose isomerase  30.85 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4665  xylose isomerase  28.28 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.025606  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06190  xylose isomerase  27.05 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.78 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3307  xylose isomerase  27.78 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0151761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0466  xylose isomerase  27.05 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1795  xylose isomerase  27.78 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000406384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6687  xylose isomerase  27.98 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  27.19 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  30.77 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01690  xylose isomerase  26.53 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2827  xylose isomerase  26.13 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3254  xylose isomerase  27.98 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0150  xylose isomerase  25.4 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0857233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1262  xylose isomerase  26.74 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0645  xylose isomerase  25.09 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12173  normal  0.0105473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22690  xylose isomerase  27.01 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1603  xylose isomerase  29.13 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2985  xylose isomerase  27.49 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0777216  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5559  xylose isomerase  27.4 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  23.73 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0353  Xylose isomerase  28.29 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  30.58 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2884  xylose isomerase  28.37 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.45 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2375  xylose isomerase  26.28 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2618  xylose isomerase  28.31 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2692  xylose isomerase  26.98 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1247  xylose isomerase  25.73 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1762  xylose isomerase  24.32 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  28.78 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>