41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1147 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 416 aa  864    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  59.12 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  54.61 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  55.05 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  55.05 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  54.61 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  54.61 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  54.61 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  55.29 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  54.24 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  55.83 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  54.13 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  54.28 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  53.72 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  54.13 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  53.88 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  54.13 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  53.88 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  53.88 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  52.76 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  53.16 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  53.37 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  54.68 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  51.2 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  50.12 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  54.07 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  56.08 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  51.55 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  49.75 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  48.28 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  25.7 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  23.86 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  23.31 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  23.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.28 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  21.25 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  23.73 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  21.15 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  23.84 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.28 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  23.85 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>