30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4132 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  85.17 
 
 		 418 aa  756    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  99.05 
 
 		 419 aa  863    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  93.54 
 
 		 419 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  93.54 
 
 		 419 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  93.78 
 
 		 419 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  93.78 
 
 		 419 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  94.02 
 
 		 419 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  80.86 
 
 		 418 aa  723    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  98.57 
 
 		 419 aa  858    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  99.52 
 
 		 419 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  85.17 
 
 		 418 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  98.8 
 
 		 416 aa  852    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  80.62 
 
 		 418 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  98.57 
 
 		 419 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 419 aa  867    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  80.62 
 
 		 420 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  84.93 
 
 		 418 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  80.38 
 
 		 420 aa  713    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  90.93 
 
 		 419 aa  804    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  98.57 
 
 		 421 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  99.76 
 
 		 419 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  63.2 
 
 		 421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  65.31 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  64.03 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  53.48 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  53.88 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  56.1 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  55.75 
 
 		 411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  49.88 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>