37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2591 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 411 aa  846    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  81.42 
 
 		 412 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  55.91 
 
 		 416 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  55.91 
 
 		 421 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  55.5 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  55.67 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  55.5 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  55.75 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  55.17 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  55.17 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  55.17 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  55.42 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  55.26 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  55.33 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  54.93 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  53.71 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  54.43 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  54.68 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  54.68 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  54.93 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  54.93 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  54.68 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  55.09 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  56.38 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  54.83 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  50.48 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  56.64 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  55.34 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  51.09 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  48.28 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  25.91 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  23.9 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  25.99 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  23.1 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  24.37 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  24.34 
 
 		 859 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  22.95 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>