31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4068 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  91.17 
 
 
419 aa  807    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  78.95 
 
 
418 aa  707    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  90.38 
 
 
416 aa  794    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  79.19 
 
 
418 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  78.95 
 
 
420 aa  709    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  90.69 
 
 
419 aa  802    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  89.95 
 
 
419 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  89.74 
 
 
419 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  89.98 
 
 
419 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  89.98 
 
 
419 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  90.21 
 
 
419 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  90.45 
 
 
421 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  90.45 
 
 
419 aa  801    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.140419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  85.65 
 
 
418 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  85.65 
 
 
418 aa  752    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  78.71 
 
 
420 aa  710    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  90.45 
 
 
419 aa  800    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  90.93 
 
 
419 aa  804    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  85.41 
 
 
418 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  100 
 
 
419 aa  867    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  91.17 
 
 
419 aa  805    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  63.68 
 
 
421 aa  569  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  64.11 
 
 
427 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  63.79 
 
 
428 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  62.83 
 
 
427 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  55.83 
 
 
416 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  53.72 
 
 
423 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  55.34 
 
 
412 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  50.36 
 
 
426 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  56.38 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  26.96 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.627849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>