32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4441 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4081  L-rhamnose isomerase  93.78 
 
 		 419 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0498  L-rhamnose isomerase  80.19 
 
 		 420 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0419  L-rhamnose isomerase  79.95 
 
 		 420 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3610  L-rhamnose isomerase  81.1 
 
 		 418 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03738  hypothetical protein  93.99 
 
 		 416 aa  824    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3486  L-rhamnose isomerase  80.86 
 
 		 418 aa  724    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5355  L-rhamnose isomerase  93.54 
 
 		 419 aa  825    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4441  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 419 aa  869    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4289  L-rhamnose isomerase  98.8 
 
 		 419 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4260  L-rhamnose isomerase  99.04 
 
 		 419 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4375  L-rhamnose isomerase  99.04 
 
 		 419 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4329  L-rhamnose isomerase  99.04 
 
 		 419 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4294  L-rhamnose isomerase  94.02 
 
 		 419 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3846  L-rhamnose isomerase  85.41 
 
 		 418 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0744  L-rhamnose isomerase  85.41 
 
 		 418 aa  759    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03789  L-rhamnose isomerase  93.78 
 
 		 421 aa  827    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4068  L-rhamnose isomerase  89.95 
 
 		 419 aa  793    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4434  L-rhamnose isomerase  93.06 
 
 		 419 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4132  L-rhamnose isomerase  93.54 
 
 		 419 aa  824    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3756  L-rhamnose isomerase  85.17 
 
 		 418 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4114  L-rhamnose isomerase  93.54 
 
 		 419 aa  824    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3315  L-rhamnose isomerase  64.99 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3787  L-rhamnose isomerase  62.71 
 
 		 421 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3455  L-rhamnose isomerase  64.35 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2730  L-rhamnose isomerase  64.27 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1301  L-rhamnose isomerase  53.96 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.889587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1147  L-rhamnose isomerase  54.24 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2437  L-rhamnose isomerase  55.61 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2591  L-rhamnose isomerase  54.43 
 
 		 411 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.490581  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0706  L-rhamnose isomerase  49.88 
 
 		 426 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  23.29 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  26.81 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>