48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2987 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2987  L-rhamnose isomerase  100 
 
 		 394 aa  795    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2856  L-rhamnose isomerase  66.75 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2455  rhamnose isomerase-related protein  67.6 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2253  L-rhamnose isomerase  59.79 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000884653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1680  rhamnose isomerase related  57.7 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0758424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.14 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0427  L-rhamnose isomerase  53.12 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0217069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1673  L-rhamnose isomerase  53.79 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0909219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6712  L-rhamnose isomerase  56.38 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3045  L-rhamnose isomerase  56.8 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1387  L-rhamnose isomerase  55.12 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0706  L-rhamnose isomerase  55.88 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0886  L-rhamnose isomerase  56.1 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3107  L-rhamnose isomerase  53.32 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05810  L-rhamnose isomerase  54.95 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3306  L-rhamnose isomerase  54.19 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.984678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4478  L-rhamnose isomerase  55.05 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3624  L-rhamnose isomerase  55.27 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000224876  normal  0.0801622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4772  L-rhamnose isomerase  55.32 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4391  rhamnose isomerase related  55.05 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0558803  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29630  L-rhamnose isomerase  53.78 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0428  L-rhamnose isomerase  55.67 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2382  L-rhamnose isomerase  56.33 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3703  L-rhamnose isomerase  53.39 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4673  L-rhamnose isomerase  52.23 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239648  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0692  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.61 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.822847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1726  xylose isomerase-like TIM barrel  44.08 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1804  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0222  L-rhamnose catabolism isomerase  42.86 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2213  L-rhamnose catabolism isomerase  44.62 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.118721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2116  L-rhamnose catabolism isomerase  41.92 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6706  L-rhamnose catabolism isomerase  41.41 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.48 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5806  L-rhamnose catabolism isomerase  40.91 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4214  xylose isomerase domain-containing protein  41.27 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0943011  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6263  L-rhamnose catabolism isomerase  40.4 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4924  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.01 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000076523  normal  0.290794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3573  L-rhamnose catabolism isomerase  40.97 
 
 		 430 aa  285  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4611  xylose isomerase domain-containing protein  39.39 
 
 		 427 aa  279  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.28145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.91 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  28.35 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2026  xylose isomerase-like TIM barrel  26.25 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  28.36 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  27.46 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  25.14 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0401  xylose isomerase-like TIM barrel  23.92 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0010085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0708  xylose isomerase domain-containing protein  24.34 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00278763  hitchhiker  0.000000000165231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>