More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45308 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  100 
 
 		 709 aa  1473    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  36.99 
 
 		 326 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.03 
 
 		 308 aa  206  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  38.95 
 
 		 296 aa  204  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0405  xylose isomerase domain-containing protein  36.49 
 
 		 298 aa  190  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2108  xylose isomerase-like  34.28 
 
 		 323 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.693114 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36777  predicted protein  37.69 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282056  normal  0.0125409 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41900  predicted protein  37.69 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0459054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2644  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.65 
 
 		 332 aa  162  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00164635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  29.79 
 
 		 309 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.8 
 
 		 308 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  29.22 
 
 		 303 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.63 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  30.09 
 
 		 307 aa  125  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30 
 
 		 311 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  30.84 
 
 		 307 aa  121  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.48 
 
 		 307 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.38 
 
 		 302 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  31.82 
 
 		 297 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  31.82 
 
 		 310 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  31.02 
 
 		 298 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.43 
 
 		 315 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.48 
 
 		 299 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  30.63 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  29.18 
 
 		 298 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.79 
 
 		 304 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  29.09 
 
 		 307 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.21 
 
 		 312 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  29.09 
 
 		 298 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.62 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.03 
 
 		 315 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.31 
 
 		 302 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.85 
 
 		 301 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  29.19 
 
 		 305 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  29.72 
 
 		 308 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  28.44 
 
 		 303 aa  108  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29.41 
 
 		 308 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  27.58 
 
 		 290 aa  108  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.63 
 
 		 308 aa  108  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.52 
 
 		 308 aa  107  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.22 
 
 		 302 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  30.82 
 
 		 309 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  26.04 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  29.33 
 
 		 319 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 305 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  31.31 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  30.33 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.29 
 
 		 313 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.04 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  28.13 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  30.51 
 
 		 298 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.79 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  30.09 
 
 		 298 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  31.04 
 
 		 317 aa  105  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19520  xylose isomerase  24.53 
 
 		 354 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  30.42 
 
 		 309 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  29.39 
 
 		 309 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.17 
 
 		 302 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  30.42 
 
 		 309 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  30.42 
 
 		 309 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  30.42 
 
 		 309 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.7 
 
 		 307 aa  104  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.7 
 
 		 305 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  27.35 
 
 		 345 aa  104  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  27.49 
 
 		 316 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  27.03 
 
 		 306 aa  103  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.88 
 
 		 308 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  30.79 
 
 		 314 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  30.79 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  29.45 
 
 		 321 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  30.79 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  30.79 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  30.79 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  29.11 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  30.12 
 
 		 309 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.81 
 
 		 302 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  29.66 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  30.49 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30.72 
 
 		 296 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  33.13 
 
 		 318 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.48 
 
 		 308 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  29.13 
 
 		 311 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  30.49 
 
 		 309 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  28.79 
 
 		 309 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  30.49 
 
 		 309 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  30.32 
 
 		 321 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  25.6 
 
 		 313 aa  101  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  31.61 
 
 		 306 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  28.83 
 
 		 311 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  28.83 
 
 		 311 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.7 
 
 		 306 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.37 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.06 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.18 
 
 		 308 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  28.14 
 
 		 306 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>