More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1363 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  49.17 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  41.99 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.67 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.33 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.04 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.2 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.67 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.87 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.5 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  44.82 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.13 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  41.08 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.56 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  37.79 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  41.28 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.28 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  34.32 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  44.82 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.33 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  37.62 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.14 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.2 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.55 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.2 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.72 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.45 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.44 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41.72 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.46 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.07 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43 
 
 		 304 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  39.12 
 
 		 424 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  36.09 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.93 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.21 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  39.46 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  37.2 
 
 		 403 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  41.12 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.57 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  32 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.87 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  40.26 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  38.54 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.51 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.44 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  35.55 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  36.6 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  35.55 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.21 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.91 
 
 		 345 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.2 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.06 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.06 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.06 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.54 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.45 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  40.8 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  36.27 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  38.54 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  38.46 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.05 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  37.25 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.93 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36.54 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  36.54 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  36.54 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  37 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.33 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.62 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  34.44 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.09 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  38.67 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  37.09 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.54 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  43 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  40 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  41.5 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.4 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.54 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 		 398 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.62 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.62 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.54 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.62 
 
 		 314 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  36.67 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.29 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.29 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.29 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.2 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.29 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  31.48 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>