More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4200 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  100 
 
 
326 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2130  ribokinase-like domain-containing protein  67.2 
 
 
322 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  60.47 
 
 
305 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  52.67 
 
 
308 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  51.51 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  51.68 
 
 
309 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  51.84 
 
 
311 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  51.84 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  51.84 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  40.6 
 
 
309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  45.12 
 
 
306 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  45.97 
 
 
302 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  46.64 
 
 
310 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  48.14 
 
 
305 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  46.98 
 
 
312 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  46.79 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  48.36 
 
 
309 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  49.83 
 
 
304 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  46.13 
 
 
308 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  42.91 
 
 
299 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  46.31 
 
 
308 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  47.47 
 
 
302 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  37.95 
 
 
310 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.11 
 
 
302 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  49.66 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.43 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  37.62 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  47.83 
 
 
309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  50.17 
 
 
297 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  46.69 
 
 
321 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  48.33 
 
 
309 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  43.19 
 
 
306 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  42.23 
 
 
308 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  42.02 
 
 
317 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  43.1 
 
 
302 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  44.19 
 
 
305 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  42.23 
 
 
308 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  42.23 
 
 
308 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  47.52 
 
 
308 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  41.28 
 
 
305 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.78 
 
 
306 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  41.33 
 
 
305 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  47.68 
 
 
324 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36 
 
 
304 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  40.67 
 
 
303 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.67 
 
 
301 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  42.81 
 
 
305 aa  202  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  47.37 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  39.93 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  39.04 
 
 
345 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.15 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  42.95 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  46.03 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  39.46 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.09 
 
 
306 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.57 
 
 
305 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  45.67 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38.41 
 
 
307 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  49.01 
 
 
308 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.93 
 
 
308 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  43.05 
 
 
302 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  49.01 
 
 
308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  49.01 
 
 
308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  45.79 
 
 
307 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  42.12 
 
 
313 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  43.67 
 
 
309 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  43.67 
 
 
309 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  43.67 
 
 
314 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  43.67 
 
 
309 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  43.67 
 
 
314 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  43.62 
 
 
309 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  43.67 
 
 
309 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  43.67 
 
 
309 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  42.05 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  41.89 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  42.28 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.47 
 
 
309 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  42.14 
 
 
308 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  42.05 
 
 
298 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  42.62 
 
 
295 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  47.97 
 
 
297 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  41.86 
 
 
298 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  41.86 
 
 
298 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  41.86 
 
 
298 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  41.86 
 
 
298 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  42.05 
 
 
298 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  42.05 
 
 
298 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  42.05 
 
 
298 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  43.96 
 
 
308 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  41.06 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  41.06 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  41.14 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  42.52 
 
 
309 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  40.73 
 
 
304 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  42.52 
 
 
309 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  42.52 
 
 
309 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  41.64 
 
 
307 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  42.52 
 
 
309 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.67 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.43 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>