More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0987 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  59.31 
 
 
291 aa  335  5e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.87 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  42.86 
 
 
295 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  45.07 
 
 
308 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  43.28 
 
 
309 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.91 
 
 
299 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.72 
 
 
303 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.74 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.4 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.4 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.4 
 
 
308 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  38.96 
 
 
308 aa  177  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.34 
 
 
301 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.33 
 
 
305 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  39.6 
 
 
307 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.68 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.74 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  39.79 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  39.31 
 
 
323 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.75 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  36.46 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  36.11 
 
 
308 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  36.46 
 
 
308 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  38.75 
 
 
303 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  38.38 
 
 
302 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  37.7 
 
 
313 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  38.41 
 
 
303 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.41 
 
 
304 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  36.81 
 
 
311 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  35.86 
 
 
302 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  37.37 
 
 
302 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  34.95 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  37.87 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  36 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  36.33 
 
 
302 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.67 
 
 
307 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.72 
 
 
303 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  36.81 
 
 
311 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  36.81 
 
 
311 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.72 
 
 
303 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  38.41 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  34.84 
 
 
310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  37.21 
 
 
310 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.53 
 
 
308 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.07 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.08 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  39.07 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  37.67 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.67 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.07 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10546  predicted protein  39.53 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.87 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.97 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.67 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.17 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.86 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  39.79 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.74 
 
 
314 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.07 
 
 
306 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.58 
 
 
305 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  39 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  36.45 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.97 
 
 
307 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.21 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  38.94 
 
 
309 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  36 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  37.67 
 
 
298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  36.27 
 
 
302 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  37.15 
 
 
424 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  35.19 
 
 
302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.15 
 
 
315 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  37.01 
 
 
309 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 
309 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  35.54 
 
 
312 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.75 
 
 
305 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  37.02 
 
 
303 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  37.02 
 
 
303 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.33 
 
 
298 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.41 
 
 
309 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.41 
 
 
309 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  38.57 
 
 
298 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.42 
 
 
306 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  33.55 
 
 
328 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  40.91 
 
 
299 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  36.54 
 
 
303 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>