More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2526 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  48.82 
 
 		 295 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  45.64 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  46.96 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  48.48 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  46.15 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  47.04 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  46.69 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  45.67 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  45.95 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  48.32 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  47.32 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  46.33 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  44.93 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.62 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  46.33 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  46.18 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  44.59 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  45.82 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  45.48 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  43.77 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  42.67 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.97 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  41.41 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  44.82 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  44.82 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  43.79 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.48 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  43.99 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  44.82 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  43.45 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  43.3 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  43.3 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  42.96 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  43.45 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  43.3 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  43.64 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  43.99 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  46.23 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  43.1 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  44.37 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.76 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.81 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  45.85 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  45.51 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  43.62 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.83 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.11 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  43.24 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.24 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  45.18 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  41.75 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  45.18 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.07 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  41.42 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  42.71 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.94 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  40.86 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  46.64 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  43.84 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  47.46 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.43 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  44.55 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.16 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  41.2 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  44.55 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.47 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  38.87 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.74 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40.13 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  39 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  39 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  39 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  39 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  39 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  44.11 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.17 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  39.66 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  43.52 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  38.34 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  39.58 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.87 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.96 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  38.61 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  44.26 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2023  ribokinase  44.07 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.93 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  40 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  40.98 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.54 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.33 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.31 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  38.54 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  38.54 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  39 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>