More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0794 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  46.36 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  45.76 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  45.72 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  45.87 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  40.13 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  43.37 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  43.42 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  43.42 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  41.91 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  41.61 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.11 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.91 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  39.4 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.39 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.74 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40.53 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  40.45 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.58 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.58 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  40.45 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.58 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  40.26 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.78 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.54 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  40.58 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.26 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.2 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.91 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.92 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.42 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.2 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  36.91 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  40.4 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.34 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.34 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.34 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  39.4 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.61 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.73 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.13 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.44 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  39.2 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  39.2 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.31 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.67 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.91 
 
 		 297 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.39 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.09 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  39.2 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.87 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  35.31 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0147  ribokinase family sugar kinase  44.23 
 
 		 208 aa  179  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  38.33 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.74 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  37.5 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  39.74 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  36.07 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.21 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  37.66 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.69 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.1 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.66 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  37.62 
 
 		 306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  38.33 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.01 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.36 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.01 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  35.67 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.14 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  40.07 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  36.95 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.91 
 
 		 308 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  38.76 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  36.95 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  35.19 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.28 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  37.95 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  37.67 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  35.41 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  36.04 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.13 
 
 		 310 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  35.99 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  36.18 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  36.04 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  38 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  37.94 
 
 		 424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.92 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  39.12 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  33.22 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  35.31 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  38.7 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  35.2 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  35.2 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  38.7 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  36.42 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>