More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0053 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  91.3 
 
 		 299 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  74.92 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  69.57 
 
 		 306 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  56.86 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  43.49 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  43.49 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.15 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.07 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  40.75 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  41.69 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  43.15 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  43.15 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.6 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.87 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  39.73 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  43.15 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.06 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.44 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.41 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  38 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.44 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  37.9 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.93 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.86 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  41.89 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.02 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.59 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  43.66 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.31 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.53 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.51 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.24 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  36.54 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.59 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.8 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  39.61 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  38.93 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  37.19 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  39.8 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40.2 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.8 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40.2 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40.2 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.33 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.8 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.88 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.31 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.2 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  36.24 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.72 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  39 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.59 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.12 
 
 		 315 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.59 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.85 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  36 
 
 		 424 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.04 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.54 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.54 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  32.78 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.54 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  38.59 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.29 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.45 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  36.77 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.26 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.26 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.26 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.63 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.26 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.26 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.69 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  34.58 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.21 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  34.98 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.11 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.46 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.7 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  44.71 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.42 
 
 		 403 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.92 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  35.45 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  35.95 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.18 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  37.92 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.46 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.71 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.82 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.91 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  36.67 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  34.56 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  42.95 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  34.56 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>