More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2296 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  41.03 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  40.71 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.31 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.26 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.74 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  44.97 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  38.96 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  42.35 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  41.88 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  40 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.32 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.72 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  45.72 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.62 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.51 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  47.39 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.31 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  43.29 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.3 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.3 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  40.98 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  43.79 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  37.66 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  37.66 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.76 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  43.96 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  45.25 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.42 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.87 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  42.62 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.59 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.91 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.19 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.46 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35.29 
 
 		 340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  42.16 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  39.55 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  37.79 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.64 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.52 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  40.98 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.62 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.19 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  41.64 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.82 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.83 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.56 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.67 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.67 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  42.02 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.67 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  39.56 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.62 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  39.67 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  41.5 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  39.67 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  39.67 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  39.67 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  45.06 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  39.67 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  37.94 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.61 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  39.67 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  42.77 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  40.07 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.14 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.83 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  41.5 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.43 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.65 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.41 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  47.04 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0641  Ribokinase  39.03 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549657  normal  0.680229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.91 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  43.29 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.03 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.72 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.4 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  40.46 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  37.42 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  43.28 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.74 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.35 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.62 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  37.99 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  37.99 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.41 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.62 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  37.01 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.62 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  42.11 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>