More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2649 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  100 
 
 
319 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  53.07 
 
 
299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  54.92 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  50.49 
 
 
299 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  47.32 
 
 
305 aa  262  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  43.87 
 
 
303 aa  245  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  44.19 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  45.66 
 
 
305 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  44.84 
 
 
303 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  44.84 
 
 
303 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  45.34 
 
 
305 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  44.37 
 
 
308 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  45.69 
 
 
307 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  43.87 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  44.19 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  44.19 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  45.74 
 
 
317 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  45.34 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  43.65 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  44.19 
 
 
303 aa  232  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  43.87 
 
 
303 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  43.87 
 
 
303 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  44.48 
 
 
304 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  39.23 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  43.73 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  43.73 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  43.73 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.79 
 
 
308 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  44.19 
 
 
303 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  43.41 
 
 
308 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.13 
 
 
302 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.8 
 
 
313 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  44.01 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.26 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  44.69 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  43.13 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.03 
 
 
309 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.34 
 
 
309 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.81 
 
 
302 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  45.34 
 
 
304 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  45.22 
 
 
308 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  43.09 
 
 
308 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  40.71 
 
 
307 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.95 
 
 
315 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.27 
 
 
310 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.72 
 
 
308 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.17 
 
 
302 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.45 
 
 
309 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.45 
 
 
309 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.45 
 
 
309 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.45 
 
 
309 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.45 
 
 
309 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.45 
 
 
314 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.45 
 
 
314 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.45 
 
 
309 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  42.63 
 
 
310 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  42.72 
 
 
309 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  42.77 
 
 
308 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  44.48 
 
 
295 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  44.05 
 
 
305 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.08 
 
 
308 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.13 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.31 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  38.78 
 
 
310 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.51 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.51 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.51 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.51 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.51 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.82 
 
 
306 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  38.17 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  39.05 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  38.17 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.61 
 
 
311 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.61 
 
 
307 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  38.85 
 
 
297 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.22 
 
 
302 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.08 
 
 
345 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  36.57 
 
 
340 aa  192  8e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  39.61 
 
 
403 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  38.46 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.7 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.55 
 
 
297 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.94 
 
 
403 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.29 
 
 
295 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
308 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.94 
 
 
309 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.94 
 
 
301 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.41 
 
 
305 aa  185  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.94 
 
 
308 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 
398 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.69 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.9 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  39.94 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41.8 
 
 
308 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  40.38 
 
 
318 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.9 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.9 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  37.54 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.97 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>