More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41900 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41900  predicted protein  100 
 
 
356 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0459054 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36777  predicted protein  100 
 
 
356 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282056  normal  0.0125409 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  37.69 
 
 
709 aa  172  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.81 
 
 
315 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  34.35 
 
 
317 aa  149  9e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.85 
 
 
309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  34.37 
 
 
305 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.64 
 
 
306 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  36.2 
 
 
313 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.4 
 
 
345 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  33.44 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.35 
 
 
309 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.15 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.15 
 
 
309 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.22 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  38.15 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.15 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.15 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.15 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  36.39 
 
 
308 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.15 
 
 
314 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.02 
 
 
310 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.15 
 
 
309 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  35.09 
 
 
309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  35.13 
 
 
302 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30.98 
 
 
311 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  31.68 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.28 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.19 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  35.91 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.64 
 
 
308 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  32.62 
 
 
304 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.64 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.64 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.07 
 
 
311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.07 
 
 
311 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  37.69 
 
 
311 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  36.73 
 
 
309 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.52 
 
 
306 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  35.14 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  36.11 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  32.71 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  33.54 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33.85 
 
 
301 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  35.91 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.23 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  35.91 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  35.91 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  35.91 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  35.06 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  32.01 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  33.64 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.4 
 
 
307 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  33.13 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  35.09 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  33.95 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.65 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  34.67 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.95 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  35.71 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.15 
 
 
305 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  36.04 
 
 
334 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  34.6 
 
 
308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.2 
 
 
314 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  35.26 
 
 
304 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.6 
 
 
308 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  34.26 
 
 
308 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  36.53 
 
 
309 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.96 
 
 
309 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  34.45 
 
 
305 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  34.06 
 
 
298 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  29.09 
 
 
308 aa  123  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  34.46 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  34.46 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  34.66 
 
 
298 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  35.89 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  34.15 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.61 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  30.37 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.53 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.06 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  33.75 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  31.66 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  34.47 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  34.15 
 
 
298 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  33.23 
 
 
298 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  29.23 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  32.62 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  34.25 
 
 
320 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  31.87 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  33.54 
 
 
298 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  32.72 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  32.2 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  33.94 
 
 
320 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  30.53 
 
 
303 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  30.53 
 
 
303 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  32.72 
 
 
295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  33.53 
 
 
319 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.82 
 
 
297 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  33.94 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>