More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  60.27 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  53.38 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  48.18 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.05 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  51.35 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  43.43 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.09 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  42.42 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  39.67 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  44.59 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.69 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.58 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  40.39 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  40.72 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  44.78 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  43.3 
 
 		 349 aa  185  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  44.98 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.67 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.5 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.75 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  44.56 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.3 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  40.13 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.92 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.47 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.06 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  38.59 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  43.27 
 
 		 327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.67 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.38 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  39.33 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.33 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.81 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  42.21 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.87 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  39.13 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  42.44 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.58 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.12 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  45.72 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  32.56 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  44.78 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  43.33 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.47 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  39.94 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  41.33 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.61 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  42.32 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.35 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.8 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.79 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.53 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  41.36 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  40.68 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.13 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  40.34 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  40.68 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.87 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  38.93 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  42.86 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  40.94 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.19 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  41.36 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.21 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  39.66 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.94 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  40 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  39.39 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  39.6 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  39.39 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  39.39 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.75 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.42 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  36.36 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.33 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  42.12 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  43.29 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  36.95 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  41.81 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  33.55 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40.94 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  38.72 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  39.06 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  42.76 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  39.06 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  39.27 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.23 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.79 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  40.67 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.67 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  40.67 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>