More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1402 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  100 
 
 		 318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  53.72 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  54.36 
 
 		 301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  46.62 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  47.79 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  48.61 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  54.67 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.98 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.61 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  50.68 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  46.13 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  44.58 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  46.64 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  41.75 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.28 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  48.26 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  46.69 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.79 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  45.12 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  42.24 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  44.44 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.77 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  45.45 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.67 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  40.45 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  47.77 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.15 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  43.33 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  45.15 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.92 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.67 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.96 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  44.78 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.22 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  43.96 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.09 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  48.15 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  40.74 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.84 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.14 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.33 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  42.41 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  43.38 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.29 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.47 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  43.05 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  44.3 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  44.16 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  46.44 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  44.15 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40.47 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  40.53 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  36.77 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.67 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  41.2 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  40.85 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  41.2 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  44.97 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.42 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  41.2 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.18 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  41.2 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  41.55 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  41.2 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.12 
 
 		 295 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  41.18 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  45.64 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.93 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.55 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.55 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.95 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  44.63 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  44.63 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.95 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.13 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.95 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.95 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.95 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.95 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.95 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.13 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  41.28 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.13 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.55 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.39 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.8 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.61 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.61 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.62 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.61 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  45.7 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.61 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.61 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>