More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1094 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  91.28 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  50.69 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  45.18 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  50.34 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.79 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.46 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.27 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  39.8 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.18 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  52.07 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  41.1 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.53 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.48 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  43.73 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.94 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.29 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.54 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  41.29 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  45.18 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.48 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.92 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  44.78 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.15 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.92 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.19 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  41.53 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  46.26 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  44.78 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.86 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  44.78 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  45.24 
 
 		 285 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.95 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.82 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.98 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.26 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.39 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.67 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  42.47 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.64 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.64 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.42 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.64 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.64 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.42 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  42.33 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  39.2 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.42 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.31 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.42 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.67 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.97 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43.29 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  43.62 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.29 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.88 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  41.58 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  36.16 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  36.16 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.56 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.74 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  40.26 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.91 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.24 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.43 
 
 		 319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.44 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  43.05 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.68 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  40.27 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  41.39 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.6 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  37.71 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  49.14 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.95 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  37.71 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  37.71 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  44.93 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.71 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  42.19 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  37.37 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.6 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.69 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  42.21 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  37.71 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  42.21 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  36.75 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  43.48 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  43.48 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  37.04 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>