More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0279 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  100 
 
 		 320 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.04 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  49.8 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  44.14 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  44.3 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  43.33 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  42.67 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  44.3 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.33 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.96 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  44.44 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.12 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.29 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.23 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  41.2 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  41.91 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.52 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.73 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  42.33 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.48 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.85 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.23 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.45 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  44.75 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  42.28 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  50 
 
 		 283 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  46.28 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.95 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.95 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.95 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.8 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.14 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.64 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  44.26 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  39.06 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  43.34 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.37 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.75 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.88 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  40.4 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.81 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.91 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.84 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.38 
 
 		 301 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.41 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.97 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.84 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.84 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  32.75 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  42.44 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.04 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  39.93 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  41.36 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  41.67 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  36.68 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.08 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.52 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.23 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.85 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.79 
 
 		 403 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1176  PfkB domain protein  48.62 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.156952  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  38.57 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.4 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.27 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.14 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  41.75 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  44.18 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  44.18 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.89 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  41.85 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.46 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.97 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.18 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  40.86 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  32.99 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.68 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  40.07 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.12 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  40.07 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  39.13 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  39.13 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  39.72 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.31 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.97 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.97 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.97 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  40.07 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  39.72 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  40.07 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  41.05 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.56 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  39.37 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.42 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  35.79 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  37.09 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>