More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2877 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  577  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  48 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  44.88 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  45.48 
 
 		 313 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  48.37 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  45.76 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  48.04 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  47.81 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  47.81 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  48.48 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.79 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  47.02 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  41.23 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  42.03 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.33 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  45.25 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  42.43 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.88 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  43.15 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  45.64 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  47.28 
 
 		 308 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.92 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  47.62 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  46.6 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.26 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.2 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  45.67 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.08 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  44.26 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  46.13 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  44.48 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  46.13 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  43.58 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.86 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.42 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  45.79 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  45.15 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.2 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.79 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  43.65 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.86 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.56 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.29 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  43.14 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.39 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  39.33 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  46.44 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43.79 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  40.66 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  43 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  44.26 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  40.66 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  40.66 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.96 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.62 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  47.28 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  43 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.5 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  46.74 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  42.02 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.07 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.46 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  45.95 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  45.95 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  36.72 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  42.3 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.33 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.84 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  36.12 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.01 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.12 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.33 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  38.98 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  44.52 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.29 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.29 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.29 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  40.97 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  40.97 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  40.97 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  40.97 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.75 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  40.97 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  40.65 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.02 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  39.41 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.25 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  41.53 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.72 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.53 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  34.85 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  44.41 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.42 
 
 		 319 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>