More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2012 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  100 
 
 		 320 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  48.03 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  51.94 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  50.49 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  43.23 
 
 		 353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  48.63 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  45.82 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  41.45 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.76 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.71 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  38.38 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.83 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.03 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.67 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.78 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  43.21 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  41.86 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.33 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.67 
 
 		 345 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.16 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.4 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.86 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.07 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.99 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  44.37 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  42.62 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  40.53 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.46 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.39 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  36.84 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  48.64 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  39.07 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  39.94 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.2 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  42.91 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.87 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.63 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.56 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.56 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.56 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.81 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42.57 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.49 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.47 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  42.38 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41.25 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.53 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.46 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  39.18 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.39 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  40.75 
 
 		 297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  42.19 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.67 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  39.54 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  38.83 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40.26 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  38.36 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.26 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.13 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  41.67 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.45 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.09 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  42.57 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  38.49 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37.37 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.08 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  41.95 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  36.1 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.02 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  42.18 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.75 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.75 
 
 		 311 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  39.04 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  31.67 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  38.67 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  38.41 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.49 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.95 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.54 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  41.95 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  41.1 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  38.08 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  41.2 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  36.51 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  41.25 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  39.67 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.67 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.58 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>