More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6178 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6178  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0426959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  40.49 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1786  formylmethionine deformylase  40.65 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  45.97 
 
 		 496 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  45.97 
 
 		 496 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  37.65 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.11 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  33.75 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  37.75 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  37.75 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  35.81 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  31.11 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.88 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.88 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  39.35 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  31.87 
 
 		 201 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  31.87 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.1 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  34.62 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  36.18 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  37.66 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  34.12 
 
 		 179 aa  91.3  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.84 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  37.09 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.16 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  34.32 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  44.66 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  36.84 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  34.43 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  31.25 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.61 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  32.68 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  36.84 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  35.8 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  33.73 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  31.25 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  35.44 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  34.9 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  29.01 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  41.32 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  36.18 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  29.01 
 
 		 202 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  33.52 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  31.25 
 
 		 201 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  35.53 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  32.93 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2092  peptide deformylase  35.76 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.91 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  33.33 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  34.18 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  36.31 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  37.19 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  38.41 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  37.19 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  28.74 
 
 		 203 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  36.31 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  32.95 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  31.21 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  35.62 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  35.76 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  31.41 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  35.06 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  34.42 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  37.18 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  37.59 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  36.84 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  34.69 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  35.48 
 
 		 196 aa  84.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  32.14 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  31.25 
 
 		 201 aa  84  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  35.4 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  36.26 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  36.08 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  34.69 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  35.52 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1501  peptide deformylase  35.53 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  34.44 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  35.06 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  39.07 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  38.16 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  34.67 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  34.67 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  34.67 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  32.1 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0521  peptide deformylase  32.67 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  34.67 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  34.67 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  30.41 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  34.23 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  36.67 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  32.12 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  31.55 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  32.89 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  33.11 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  37.09 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  36.14 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>