More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4480 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4480  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 429 aa  872    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  41.82 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  41.39 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  40.79 
 
 		 514 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  37.22 
 
 		 502 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  39.71 
 
 		 377 aa  233  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 515 aa  232  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.1 
 
 		 505 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  35 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.46 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  39.03 
 
 		 491 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  41.16 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.57 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  35.53 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.94 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  38.96 
 
 		 492 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  38.46 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  39.26 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  34.8 
 
 		 520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  37.25 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  39.11 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  36.42 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  39.94 
 
 		 525 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  36.03 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  39.56 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  40.72 
 
 		 407 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  36.54 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  36.81 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  38.94 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  35.77 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  40.18 
 
 		 516 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  36.68 
 
 		 508 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  35.62 
 
 		 510 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  37.87 
 
 		 520 aa  213  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  35.37 
 
 		 490 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  38.65 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  37.95 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  37.04 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  40.5 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  35.15 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  38.94 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  40.5 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  35.52 
 
 		 507 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  35.38 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  36.29 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  38.64 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  37.53 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  38.3 
 
 		 386 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  38.06 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  40.41 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  37.25 
 
 		 506 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  37.63 
 
 		 511 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  37.75 
 
 		 520 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  37.39 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  37.85 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  37.82 
 
 		 520 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  39.4 
 
 		 517 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  35.14 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  37.23 
 
 		 513 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  39.94 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  35.66 
 
 		 505 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  38.7 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  37.82 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  38.81 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  38.04 
 
 		 521 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  38.42 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  39.94 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  34.32 
 
 		 384 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  35.85 
 
 		 513 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  36.59 
 
 		 516 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  36.62 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  36.96 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  34.38 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  37.71 
 
 		 505 aa  206  9e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  36.52 
 
 		 532 aa  206  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  38.83 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  36.44 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  38.83 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  38.83 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  35.85 
 
 		 513 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  38.5 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  38.91 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  33.25 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  35.8 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  37.57 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  38.98 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  35.11 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  37.13 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  38.38 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  38.7 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  37.07 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  36.9 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  34.69 
 
 		 518 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  39.34 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  37.75 
 
 		 514 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  38.9 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>