More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2210 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2210  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 348 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  0.119869 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  31.02 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  30.18 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  36.55 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  25.75 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  30.04 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  28.12 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  33.65 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  28.25 
 
 		 324 aa  85.9  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.2 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  28.32 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4923  Polyprenyl synthetase  30.38 
 
 		 768 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  32.02 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  29.19 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  26.98 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  24.39 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  31.4 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.41 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  25.52 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  23.73 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  27.78 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  29.56 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  25.42 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.67 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  27.27 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.43 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.51 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  27.48 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.86 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  28.84 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.98 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  26.21 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  27.73 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  27.73 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  28.11 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00090  farnesyltranstransferase, putative  27.42 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.48 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  27.11 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.7 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  27.11 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  26.23 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  26.7 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.57 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  30.32 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  27.03 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  27.69 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4379  Polyprenyl synthetase  32.26 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  26.82 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  25.65 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.05 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  26.22 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  32.08 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  25.66 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  29.15 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  27.31 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46658  geranylgeranyl diphosphate synthase  29.6 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.606185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  27.59 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  27.94 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.29 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.17 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1235  polyprenyl synthetase  26.48 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.347308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.21 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  31.18 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.53 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  25.48 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  26.82 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  28.09 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  26.92 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  27.49 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  29.5 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  29.79 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  29.95 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  27.9 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  27.91 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  26.24 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  28.39 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  25.84 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  28.68 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  28.52 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  27.57 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  27.78 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  31.97 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.44 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.84 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  28.29 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  25.29 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>