More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0212 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
551 aa  1083    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.57 
 
 
546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  36.68 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
1382 aa  290  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  40.08 
 
 
542 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  40.93 
 
 
524 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
528 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
524 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  40.09 
 
 
516 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  39.11 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 
526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  38.66 
 
 
519 aa  226  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.22 
 
 
519 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  34.07 
 
 
518 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.72 
 
 
523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  48.01 
 
 
509 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  40.22 
 
 
519 aa  213  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  39.13 
 
 
519 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.9 
 
 
516 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  37.12 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  48.45 
 
 
510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  34.04 
 
 
537 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  38.65 
 
 
527 aa  190  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  38.65 
 
 
527 aa  190  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  36.56 
 
 
535 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  33.78 
 
 
501 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 
554 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.44 
 
 
559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.17 
 
 
560 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.29 
 
 
733 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  35.37 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.38 
 
 
625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  34.33 
 
 
641 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.22 
 
 
770 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  36.58 
 
 
559 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1357  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.11 
 
 
688 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592157  normal  0.205396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1336  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.76 
 
 
690 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.79 
 
 
565 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.79 
 
 
565 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  33.22 
 
 
633 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  32.42 
 
 
695 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  34.5 
 
 
642 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4733  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.11 
 
 
689 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0478983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.66 
 
 
762 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.86 
 
 
566 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  30.54 
 
 
651 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.54 
 
 
645 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.84 
 
 
666 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.74 
 
 
639 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.79 
 
 
750 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.55 
 
 
758 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  31.5 
 
 
692 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.77 
 
 
656 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  30.24 
 
 
652 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.65 
 
 
678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.22 
 
 
622 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.55 
 
 
659 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.97 
 
 
641 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  34.59 
 
 
634 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  34.53 
 
 
668 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.55 
 
 
654 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.32 
 
 
675 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1250  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
513 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.55 
 
 
660 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  32.55 
 
 
768 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  31.21 
 
 
686 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  30.23 
 
 
670 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.49 
 
 
674 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  33.55 
 
 
770 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.73 
 
 
666 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  32.14 
 
 
692 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.97 
 
 
681 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  35.29 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  31.8 
 
 
686 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.61 
 
 
642 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.65 
 
 
676 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  29.84 
 
 
661 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 
495 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.49 
 
 
670 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  32.19 
 
 
636 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.94 
 
 
643 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  32.89 
 
 
683 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  29.84 
 
 
661 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30 
 
 
671 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.11 
 
 
703 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  33.44 
 
 
638 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  35.29 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.11 
 
 
703 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  31.19 
 
 
686 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.63 
 
 
678 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  31.82 
 
 
695 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  31.72 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.23 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.69 
 
 
679 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  30.95 
 
 
663 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.31 
 
 
673 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  31.12 
 
 
664 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  32.13 
 
 
610 aa  135  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.89 
 
 
759 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>