More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2488 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3364  transcriptional regulator, HxlR family  67.65 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159843  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  68.32 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1542  transcriptional regulator, HxlR family  65.09 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  69.47 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  31.48 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  36 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  32.98 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  32.98 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  34.02 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  35.71 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  33.62 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  31.31 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  43.37 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  33.94 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  35.92 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  32.65 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1393  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000189359  hitchhiker  8.40763e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  35.35 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  32.65 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  30.93 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  36 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3451  transcriptional regulator, HxlR family  41.25 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>