More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3451 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3451  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  260  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  39.53 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  45.12 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38.75 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  35.23 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  40.7 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  39.51 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  39.51 
 
 		 106 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  35 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  34.52 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  39.29 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  30.56 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  32.14 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  34.57 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  41.25 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  38.03 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  38.36 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  34.57 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  36.9 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  42.17 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  37.8 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  38.81 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  30.49 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  31.71 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  35.8 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  33.72 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  35.9 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  34.52 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  34.18 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  35.44 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  39.44 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  34.18 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  39.44 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  28.75 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  39.44 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  39.44 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  29.27 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  32.08 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  29.27 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  29.27 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  29.27 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  32.91 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  32.95 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  32.56 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>