66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2213 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  100 
 
 		 644 aa  1304    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  65.49 
 
 		 588 aa  713    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  69.31 
 
 		 583 aa  778    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  69.96 
 
 		 640 aa  812    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  70.35 
 
 		 614 aa  819    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  22.73 
 
 		 655 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  21.81 
 
 		 657 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  25.06 
 
 		 466 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  24.33 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.77 
 
 		 775 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.92 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.17 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.56 
 
 		 798 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.2 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  26.24 
 
 		 801 aa  60.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.63 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  22.08 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.62 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.13 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  23.43 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  21.89 
 
 		 753 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  26.92 
 
 		 798 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  23.49 
 
 		 779 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  31.53 
 
 		 749 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  22.82 
 
 		 766 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.87 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.26 
 
 		 774 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.51 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.15 
 
 		 750 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.18 
 
 		 758 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  26.87 
 
 		 773 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  21.67 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.55 
 
 		 691 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.71 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  22.15 
 
 		 753 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  22.04 
 
 		 691 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.34 
 
 		 790 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  26.36 
 
 		 757 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.98 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  27.68 
 
 		 654 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  26.78 
 
 		 766 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  26.78 
 
 		 766 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25.48 
 
 		 755 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25.48 
 
 		 746 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25.48 
 
 		 755 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  26.36 
 
 		 766 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  25.52 
 
 		 766 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  26.36 
 
 		 766 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  28 
 
 		 614 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  25 
 
 		 986 aa  47  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.19 
 
 		 756 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  24.04 
 
 		 785 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  25.94 
 
 		 766 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 978 aa  46.2  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  24.1 
 
 		 851 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  22.26 
 
 		 781 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  23.25 
 
 		 669 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  37.97 
 
 		 806 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.3 
 
 		 781 aa  44.3  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  36.46 
 
 		 857 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.06 
 
 		 710 aa  43.9  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.26 
 
 		 674 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  24.71 
 
 		 431 aa  43.9  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>