More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1883 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1883  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 682 aa  1363    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 696 aa  127  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 701 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 711 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 828 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 712 aa  118  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 740 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  24.87 
 
 		 696 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 829 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  24.87 
 
 		 696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.87 
 
 		 696 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.34 
 
 		 698 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 828 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 705 aa  111  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 710 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 748 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 710 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.96 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 699 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25 
 
 		 696 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 701 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 817 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 748 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 778 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.33 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 748 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 702 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 702 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.2 
 
 		 709 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.25 
 
 		 703 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.08 
 
 		 689 aa  107  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 720 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 793 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 771 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  26.58 
 
 		 699 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 708 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 724 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 701 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 718 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  23.31 
 
 		 799 aa  104  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  24.42 
 
 		 726 aa  104  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.12 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 791 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 757 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.37 
 
 		 801 aa  101  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 717 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  24.96 
 
 		 791 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 714 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 707 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 703 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 722 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 701 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 724 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 701 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 710 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.76 
 
 		 833 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.58 
 
 		 703 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.33 
 
 		 703 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 736 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 723 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 723 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.77 
 
 		 708 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 736 aa  98.2  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 708 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 799 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 799 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 699 aa  97.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 701 aa  97.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 705 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  22.79 
 
 		 729 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 712 aa  97.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.35 
 
 		 724 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 721 aa  96.3  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 720 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  23.98 
 
 		 724 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 771 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 778 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 708 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 708 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 720 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 766 aa  94.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 797 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 709 aa  94  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 707 aa  94  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 797 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  22.51 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 715 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  21.67 
 
 		 738 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 715 aa  93.2  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 713 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 705 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>