More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0259 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 412 aa  777    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  47.16 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  40.69 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.74 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.31 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.94 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25.61 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.84 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  22.71 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3899  secretion protein HlyD  29.49 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  29.95 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.52 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.09 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.27 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  30.16 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  28.57 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.64 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  32.65 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  24.73 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  30.73 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  30.09 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  24.73 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  28.32 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  23.77 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  25 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  32.2 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  26.49 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  24.46 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  24.39 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  24.46 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  24.46 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  31.03 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  24.46 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25.91 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  23.31 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1438  secretion protein HlyD  26.33 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.46 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  25.13 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  28.72 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  27.78 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2916  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.25 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  28.77 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  22.43 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  26.02 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.74 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  22.9 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  28.04 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  27.66 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.1 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  30.22 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  31.1 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  22.8 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  30.05 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  32.02 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  23.53 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  22.82 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.69 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  31.03 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  24.46 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  31.03 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>