More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5085 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5085  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  59.62 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.94 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 879 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  41.67 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1853  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 309 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4590  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 258 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1242  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0473699  normal  0.519491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 209 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2513  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 246 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0619  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  45.1 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2930  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  44.23 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0613  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0682847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0574  LuxR family DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5117  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.180541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  39.06 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 562 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3630  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 232 aa  48.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00295856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1975  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000126323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 339 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  48.08 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3000  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.42213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4948  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.35356  normal  0.196222 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 241 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  42.59 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  42.59 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  42.59 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.59 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.92 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 316 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  50 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 305 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 257 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 250 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 257 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  39.66 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>