More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4590 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4590  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0619  two component LuxR family transcriptional regulator  84.88 
 
 		 258 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0613  two component LuxR family transcriptional regulator  82.56 
 
 		 258 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0682847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0574  LuxR family DNA-binding response regulator  82.56 
 
 		 258 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4376  LuxR response regulator receiver  60.7 
 
 		 265 aa  307  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4836  DNA binding response regulator, LuxR family  62.9 
 
 		 260 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55810  putative two-component response regulator  50.38 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4863  LuxR family DNA-binding response regulator  51.78 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.090532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2151  two component LuxR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.51 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.51 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 216 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 216 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.09 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 		 227 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  25.85 
 
 		 225 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.96 
 
 		 236 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.9 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.31 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  27.02 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  26.98 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.22 
 
 		 470 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.84 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.51 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  29.54 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.51 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.51 
 
 		 446 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.96 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  28.51 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 453 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2330  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.34 
 
 		 466 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4847  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0738416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.14 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1155 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1155 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1149 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1155 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.14 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1163 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.2 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  31.61 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  33.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  33.81 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  33.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>