More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0137 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  38.49 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  38.01 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  33.76 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  38.56 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  35.57 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  36.18 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  35.84 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  39.38 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  39.25 
 
 		 627 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  40.27 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.67 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  35.84 
 
 		 316 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  36.9 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  35.17 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.55 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  35.08 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  35.42 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  36.39 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  35.76 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  35.76 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  32.09 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  35.93 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  32.43 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  36.21 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  34.32 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  35.48 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  34.38 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  31.76 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  34.71 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  30.29 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  36.52 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  31.68 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  35.84 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  35.69 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  34.14 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  32.32 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  34.26 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  34.23 
 
 		 333 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  33.22 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  34.6 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  32.14 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  32.62 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  34.26 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  33.56 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  34.47 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  32.12 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  32.46 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  29.97 
 
 		 327 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  32.11 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  33.56 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  31.76 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  32.99 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  34.13 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  34.72 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  33.79 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  34.56 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  34.13 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2638  D-alanine--D-alanine ligase  35.25 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.482426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  31.35 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  31.21 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  33.79 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  34.72 
 
 		 311 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0009  D-alanine/D-alanine ligase  34.13 
 
 		 338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.542001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  34.23 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  32.88 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  32.88 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  34.23 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  32.53 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  34.36 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  32 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  30.94 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  34.11 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  33.68 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  30.54 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  32.99 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  30.59 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  34.14 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  32.65 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  30.23 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  32.99 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>