More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4428 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 455 aa  908    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  67.03 
 
 		 455 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  66.15 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  64.11 
 
 		 457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  62.06 
 
 		 456 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  55.7 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  49.57 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  45.63 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  45.34 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  49.23 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  45.87 
 
 		 460 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  44.76 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  45.34 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  44.42 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  43.64 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  45.18 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  44.69 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  40.92 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  45.77 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  43.04 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  42.54 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  47.65 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  42.07 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  42.83 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  42.32 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  42.61 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  42.48 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  45.24 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  41.79 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  43.13 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  41.79 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  45.02 
 
 		 458 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 		 471 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  47.92 
 
 		 452 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  43.36 
 
 		 465 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  43.79 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  43.91 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  41.47 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  40.97 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  41.7 
 
 		 464 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  43.35 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  40.75 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  41.23 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  43.47 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 		 461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  41.81 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  38.49 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  41.38 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 473 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  40.09 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  37.63 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 450 aa  308  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  38.3 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  41.19 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  38.09 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  36.68 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 455 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 457 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  38.84 
 
 		 473 aa  302  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 455 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  40.35 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  39.43 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  39.04 
 
 		 478 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.05 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>