More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2536 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  80.19 
 
 		 420 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  67.72 
 
 		 417 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 410 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  27.21 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 429 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  26.2 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  26.45 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.04 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  32.24 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.85 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  24.76 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  28.32 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  28.32 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  28.32 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  26.64 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.73 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  26.24 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.24 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  26.24 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  29.24 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  29.24 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  29.24 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>