118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0785 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 453 aa  920    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  66.59 
 
 		 452 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  66.37 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  53.42 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  37.3 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  27.27 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0762  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.35 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.38 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.51 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.43 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.4 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0302  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.019197  normal  0.0220531 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.62 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.58 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1470 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.67 
 
 		 452 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  21.01 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.54 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.94 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 1496 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.74 
 
 		 501 aa  50.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.94 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.94 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  20.52 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  25.07 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.15 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.3 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.46 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.63 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2738  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  24.57 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.23 
 
 		 519 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>